O IMPERADOR E O ASSASSINO conta a história de Ying Zheng, um poderoso e ambicioso herdeiro do trono do Reino de Qin que, no século III A.C tem como único objectivo conquistar os outros seis reinos existentes na China, dominá-los e governar segundo as suas próprias leis, tornando-se o primeiro imperador. Para o conseguir, inicia um reinado de terror e brutalidade contra todos aqueles que ele acredita serem os opositores ao cumprimento do seu grandioso destino. Na preparação do segundo dos seus seis assaltos, Ying conquista a cumplicidade da concubina Zhao, sua amante desde a infância, que viaja até ao Reino de Yan como espia, com o objectivo de fazer o rei acreditar que ela está do lado do Reino de Ying, ao conseguir encontrar uma justificação legítima para a invasão do Reino de Yan, o maior obstáculo à unificação: uma tentativa de assassinato do imperador. Ao chegar ao Reino de Yan, junta-se ao seu rei para encontrar o assassino que matará Ying, que estará preparado e é considerado imparável na sua própria defesa. Ao passear pelo mercado de Yan, Zhao descobre Jing Ke, um hábil guerreiro que Zhao aborda no sentido de se tornar o assassino que procura. E ela usará todos os seus meios de persuasão para convencer este homem modesto a cumprir a grandiosa tarefa. No entanto, antes de qualquer um dos planos conseguir ser concretizado, Ying Zheng descobre um doloroso segredo sobre o seu nascimento. A surpreendente revelação incita o seu instinto de sangue-frio. Todas as pessoas que souberem da sua verdadeira linhagem têm de morrer. E prepara um sangrento ataque à terra natal de Lady Zhao, que ela tanto ama. A violenta incursão inclui a matança de muitas crianças inocentes, o que viola uma promessa solene anteriormente feita a Lady Zhao. Ela vê-se agora forçada a voltar-se contra o seu amante. Apesar do seu afecto por ele ser grande, ela não poderá aceitar por mais tempo a sua forma de governar. E a conspiração para assassinar o imperador torna-se agora real. Ironicamente, ela e o assassino acabam por se apaixonar. Quando a conspiração de assassinato falha e Jing Ke é morto, Zhao regressa a Qin para reclamar o corpo do amante. No seu derradeiro encontro com Ying Zheng, ela confronta-o e condena-o por todo o horror que causou. Parte, deixando o rei forjar o seu grande império sozinho.