Passado no Texas dos dias de hoje, PELA MÃO DO SENHOR centra a sua história na procura, pelo FBI, de um assassino em série que se intitula as "Mãos de Deus". Matthew McConaughey desempenha o papel de Fenton Meeks, um jovem que uma noite procura o agente responsável pela investigação para lhe revelar que sabe quem é o assassino. Embora intrigado o agente da FBI mostra-se pouco impressionado com a revelação até Fenton lhe revelar que o assassino é seu irmão. Numa série de flashbacks, Fenton relembra como ele e o irmão cresceram no seio de uma família carinhosa, criados pelo pai viúvo (Bill Paxton). Numa noite, tudo se altera quando o pai acorda acreditando ter sido visitado por um anjo, que lhe dá ordem para destruir os "demónios" que caminham sobre a terra - pessoas de aparência normal que personificam o mal. O pai e o irmão Adam juram cumprir essa missão divina. Fenton recusa-se e tenta convencer o irmão, mas rápidamente se apercebe que ambos tinham enloquecido. Por lealdade, recusa-se a denunciá-los à polícia... até agora. O agente acredita nesta perturbante história e acaba por seguir Fenton até ao roseiral da família onde descobre que o mal e a inocência nem sempre são o que aparentam.